दुय्यम सांडपाणी प्रक्रिया प्रक्रिया सांडपाण्यामधून दूषित पदार्थांचे जैविक दृष्ट्या दूर करण्यासाठी सूक्ष्मजीव वापरतात. दुय्यम जैविक प्रक्रिया एरोबिक किंवा aनेरोबिक असू शकतात, प्रत्येक प्रक्रिया भिन्न प्रकारचे बॅक्टेरियाच्या समुदायाचा वापर करते.